MLPA y digitalMLPA

Kit screening anomalías genéticas

MLPA

Técnica de referencia en la determinación del número de copias

SALSA® MLPA® (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) es la técnica de referencia para estudiar las variaciones en el número de copias (CNVs) asociadas a enfermedades. Con el método optimizado basado en PCR múltiple de MLPA, es posible detectar deleciones y duplicaciones en hasta 60 secuencias de ADN en una sola reacción, sin sesgo de los cebadores. Laboratorios de todo el mundo confían en MLPA para estudiar trastornos genéticos y tumores.

    • Versatilidad: MLPA se puede utilizar para detectar CNVs a distintos niveles, desde cromosomas completos hasta exones individuales, y también para detectar cambios en la metilación del ADN (MS-MLPA).
      Más información 
    • Sensibilidad: es lo suficientemente sensible como para discriminar de manera fiable las aberraciones en los genes causantes de enfermedades de pseudogenes muy similares.
    • Sencillo: fácil de llevar a cabo, análisis simple y resultados claros.
    • Rentable: ejecutado en equipos de laboratorio estándar y con un bajo coste.
  • MLPA es una técnica de PCR múltiple sencilla que utiliza un único par de cebadores para amplificar hasta 60 sondas, cada una con una diana genómica y longitud únicas. Los amplicones de la PCR se marcan con fluorescencia y se separan y cuantifican mediante electroforesis capilar. Comparando el patrón de picos resultante de una muestra con los de un conjunto de muestras de referencia, puede determinarse el número de dianas genómicas presentes en la muestra de interés.

    El MLPA específico de metilación (MS-MLPA) es una variante de la técnica SALSA® MLPA®. Combinar MLPA con la endonucleasa sensible a metilación Hhal permite la detección tanto del número de copias de ADN como del estado de metilación. Con MS-MLPA, se consigue fácilmente un perfil de metilación semicuantitativo de múltiples dianas sin necesidad de un tratamiento con bisulfito.

    Para más información o una explicación detallada de la técnica, puede visitar:

  • Las CNVs están presentes en cientos de trastornos genéticos, y existen ensayos de MLPA incluso para los menos frecuentes.

    Aquí puede encontrar una lista completa de todos los kits de MLPA disponibles: https://www.mrcholland.com/products

  • Coffalyser.Net es un software de análisis gratuito creado y respaldado por MRC Holland. Importa directamente archivos de datos sin procesar, y realiza comprobaciones de calidad avanzadas y análisis de datos para aumentar la solidez de sus resultados. Las hojas de análisis de cada producto pueden recuperarse directamente de los servidores, lo que garantiza que siempre tenga acceso a las últimas versiones.

digitalMLPA

Donde MLPA se une a la NGS para una mayor certeza en el número de copias

SALSA® digitalMLPA es una PCR multiplex seguida de una cuantificación de amplicones basada en secuenciación Illumina, para la detección de variaciones en el número de copias (CNVs) y mutaciones puntuales específicas. Con digitalMLPA, se pueden detectar y cuantificar hasta 1000 secuencias únicas en una sola reacción.

La técnica digitalMLPA es similar a SALSA® MLPA®, la técnica de referencia para la detección de CNV, pero con la capacidad de examinar muchas más dianas en una sola reacción. Las muestras de digitalMLPA pueden combinarse con otras bibliotecas de secuenciación NGS en un solo proceso para obtener resultados simultáneos de cuantificación fiable de CNVs y análisis de secuencias NGS. Esto ahorra tiempo y dinero, garantizando el cumplimiento de los plazos de entrega de las muestras.

Los productos SALSA digitalMLPA son para uso exclusivo en investigación (RUO). No deben utilizarse en procedimientos de diagnóstico.

    • Específico: certeza inigualable del número de copias para regiones genéticas complejas
    • Rentable: hasta 1000 sondas en una sola reacción
    • Fácil: sencillos pasos prácticos sin necesidad de cuantificación de bibliotecas
    • Robusto: solo se necesitan 20ng de muestra para una cobertura uniforme
    • Sencillo: software gratuito, análisis simple y resultados claros
  • digitalMLPA es una técnica basada en PCR que permite la detección de hasta 1000 secuencias de ADN diana en una única reacción multiplex. Tras la generación de amplicones basada en PCR, los amplicones de cada sonda se cuantifican mediante una plataforma NGS de Illumina. digitalMLPA no requiere de una limpieza posterior a la PCR ni de mediciones de concentración de bibliotecas, lo que hace que la técnica sea eficiente y fácil de usar.
    Para más información o una explicación detallada de la técnica, puede visitar:

  • Nuestra gama actual de paneles se centra en marcadores de cáncer hereditario, así como en neoplasias hematológicas, incluyendo el mieloma múltiple y la leucemia linfoblástica aguda. Además de los productos actuales, se están desarrollando activamente nuevos ensayos de digitalMLPA para una amplia gama de aplicaciones.

    • SALSA® digitalMLPA™ Probemix D001 Hereditary Cancer Panel 1: Detecta CNVs en 28 oncogenes relevantes. Las CNVs en estos genes están asociadas con una predisposición hereditaria a una variedad de tipos de cáncer incluyendo de mama, ovario, colorrectal, estómago, próstata, páncreas, endometrio y melanoma.
    • SALSA® digitalMLPA™ Probemix D006 Multiple Myeloma: Detecta anomalías en el número de copias de varios brazos cromosómicos (1p, 1q, 13q, 17p) y de genes asociados a mieloma múltiple. Además, el panel detecta trisomías, hiper- e hipodiploidías y la mutación BRAF V600E asociada a esta neoplasia.
    • SALSA® digitalMLPA™ Probemix D007 Acute Lymphoblastic Leukemia: Detecta ganancias y pérdidas en 52 genes y 3 regiones cromosómicas (5q, iAMP21 and PAR1) asociados con LLA. El panel se puede utilizar para examinar anomalías intragénicas en el número de copias, aneuploidías, ganancias y pérdidas cromosómicas parciales y amplificaciones de alto nivel, así como cambios de ploidía y fusiones génicas intracromosómicas.
    • Sencillo: los archivos FASTQ se cargan directamente en el software
    • Inteligente: reconocimiento automático del panel y reads de digitalMLPA
    • Fiable: ampliamente probado y validado
    • Seguro: exhaustivo control de calidad incorporado

    Coffalyser digitalMLPA es un software gratuito y fácil de usar desarrollado por MRC Holland y construido específicamente para el análisis de datos de digitalMLPA. El software reconoce y extrae automáticamente las lecturas de secuencia de digitalMLPA de los archivos FASTQ. Todo esto seguido de avanzados controles de calidad de los datos, y la generación de un informe claro que muestra todas las regiones aberrantes detectadas.